Vahlenkamp leitet seit 2010 das Institut für Virologie der Veterinärmedizinischen Fakultät. Seit 2019 verantwortet er als Dekan zudem die Entwicklung der Fakultät. Mit seiner wissenschaftlichen Expertise und seiner engen Verbindung zum Standort Leipzig wird er die inhaltliche Ausrichtung des Leipziger Tierärztekongresses maßgeblich mitgestalten.

Ein Schwerpunkt seiner Arbeit liegt auf der Weiterentwicklung des wissenschaftlichen Programms. Zugleich wird er die enge Verzahnung von Kongress, Fachmesse und aktuellen Themen der Veterinärmedizin weiter stärken.